قضى الدكتور مغير خميس الخييلي العقد الأول من حياته المهنية في الدائرة الخاصة للراحل المغفور له بإذن الله الشيخ زايد بن سلطان آل نهيان. شغل العديد من المناصب المرموقة في القسم ، بدءا من المدقق المالي إلى المدير العام ، ومساعد وكيل الوزارة. في عام 2005 ، تم تعيينه أمينًا عامًا لجامعة الإمارات العربية المتحدة ، وفي عام 2007 أصبح عضوًا في المجلس الوطني الاتحادي ، ومجلس أمناء جامعة خليفة ، والفريق الإداري لجامعة السوربون باريس-أبو ظبي ، والمجلس الاستشاري لجامعة أكسفورد.